ระบบสืบพันธุ์เพศชายประกอบด้วยองคชาตภายนอก (องคชาต อัณฑะ และถุงอัณฑะ) และส่วนภายใน รวมทั้งต่อมลูกหมาก ท่อนำอสุจิ ถุงอัณฑะ และท่อปัสสาวะ ภาวะเจริญพันธุ์และลักษณะทางเพศของผู้ชายขึ้นอยู่กับการทำงานปกติของระบบสืบพันธุ์เพศชาย เช่นเดียวกับฮอร์โมนที่หลั่งออกมาจากสมอง